Trước đó, cuối năm 2017, qua kiểm tra, Sở Tài Nguyên và Môi trường tỉnh Kon Tum đã phát hiện trong quá trình vận hành thử nghiệm, nhà máy chế biến mủ cao su trên có nhiều sai phạm như: chưa báo cáo UBND tỉnh cho phép điều chỉnh tiến độ đầu tư; bổ sung dòng thải phát sinh mà không có trong báo cáo đánh giá tác động môi trường (nước làm mát, nước ngấm từ các hồ xử lý nước thải do một số vị trí bị nứt); tự ý tổ chức vận hành dây chuyền sản xuất mủ tạp trong khi chưa đầu tư hoàn chỉnh dây chuyền sản xuất.
Cho nhà máy hoạt động thử nghiệm khi hết thời gian đăng ký; xả thải ra môi trường khi chưa có giấy phép; không chấp hành quyết định xử phạt vi phạm hành chính của Thanh tra Sở Tài Nguyên và Môi trường về bảo vệ môi trường, tài nguyên nước; chưa chấp hành các chủ trương của UBND tỉnh về đầu tư hệ thống xử lý nước thải loại A và lắp đặt hệ thống quan trắc tự động đối với nhà máy.
Việc Nhà máy chế biến mủ cao su ngay trong quá trình hoạt động thử nghiệm đã gây ô nhiễm môi trường khiến người dân bức xúc. Nhiều cử tri đã có ý kiến về vụ việc trên.