Dù đã có những nỗ lực phát triển với nhiều doanh nghiệp ươm tạo thành công và phát triển. Tuy nhiên, hoạt động của các vườn ươm, nhất là các cơ sở công lập, hiện gặp nhiều khó khăn cả về sơ sở vật chất, vốn và cơ chế chính sách. 

Xuất hiện ở Việt Nam hơn 10 năm nay, vườn ươm doanh nghiệp đã và đang được chú trọng nhằm hỗ trợ các doanh nghiệp trong giai đoạn đầu phát triển với phần lớn hoạt động trong lĩnh vực về công nghệ. Những kết quả ban đầu là đáng khích lệ khi có nhiều doanh nghiệp ươm tạo thành công và có thị trường sản phẩm tốt. Tuy nhiên, với nhu cầu phát triển mạnh mẽ hiện nay, đặc biệt là phong trào khởi nghiệp, các vườn ươm đã bắt đầu bộc lộ những hạn chế, đòi hỏi phải đổi mới để phát triển.