Các loại sâu bệnh gây hại cho cây bơ hạt lép chủ yếu là sâu cuốn lá, rầy bông và bệnh thối rễ, bà còn trồng cần chú ý các loại sâu bệnh này để tránh ảnh hưởng đến năng suất và chất lượng của cây bơ hạt lép.