Vùng đất ngập nước ven biển của tỉnh Phú Yên có diện tích 504,2 ha, phân bố trên 3 thủy vực là đầm Cù Mông (226 ha), vịnh Xuân Đài (95,7 ha) và đầm Ô Loan (182,5 ha). Đây là vùng có ý nghĩa quan trọng đối với sinh kế của người dân địa phương, cung cấp ngư trường và mặt nước cho hoạt động khai thác, nuôi trồng thủy hải sản. Đặc biệt, diện tích rừng ngập mặn ven đầm, vịnh còn góp phần điều hòa khí hậu, bảo vệ môi trường và đa dạng sinh học. Nhưng những năm gần đây, vùng đất ngập nước ven biển của Phú Yên đang chịu nhiều tác động từ các hoạt động phát triển kinh tế - xã hội, cũng như thiên tai, làm suy thoái sinh cảnh và tài nguyên thủy sinh, gây ô nhiễm môi trường biển ven bờ.